2018年7月，吴息凤教授团队在《Gut》上发表题为“The somatic mutation landscape of premalignant colorectal adenoma”的研究。该研究构建了结直肠腺瘤基因突变图谱并揭示了从结直肠腺瘤进展到癌症的分子生物标志物。
该研究通过对149例腺瘤标本和配对血液标本进行了全外显子组测序和靶向测序。将鉴定出的体细胞突变与来自TCGA的结直肠癌（CRC）样本中的体细胞突变进行比较。确定了从大肠腺瘤到腺癌进展的分子标志物。研究发现，在非晚期和晚期常规腺瘤和大肠癌组织中，经多重比较调整后，TP53、PIK3CA、KRAS、APC和SMAD4五个基因的非沉默突变频率具有统计学意义差异。例如，大肠腺瘤中的TP53突变完全是错义突变，而大肠癌中四分之一的突变是截断突变。用随机森林分类法，鉴别出促进腺瘤进展到结直肠癌的20个最重要基因，模型AUC达0.941。
图1 基因突变频率与疾病进展的关系
图2 从传统腺瘤到非高突变结直肠癌恶性进展的预测模型