2020年8月，吴息凤教授团队在《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》上发表题为“Genetic associations of T cell cancer immune response-related genes with T cell phenotypes and clinical outcomes of early-stage lung cancer”的研究。该研究揭示了T细胞癌免疫应答相关基因与早期肺癌T细胞表型和临床结局的遗传相关性。
T细胞相关免疫治疗的最新进展显著促进了非小细胞肺癌（NSCLC）的治疗。然而，T细胞癌免疫应答基因的遗传变异是否以及如何影响非小细胞肺癌患者的临床结局仍不清楚。为此，本研究评估了941例早期NSCLC患者（发现集n=536；验证集n=405）中280个T细胞癌免疫应答相关基因的2450个单核苷酸多态性（SNPs），以分析其与预后的关联，并观察其对T细胞表型的影响。
研究发现，在发现集和验证集中位于10个基因的14个SNP与NSCLC的预后显著相关（p<0.05）。其中，TRB:rs1964986是荟萃分析后与复发风险最相关的变异（HR 1.84，95%CI 1.35 - 2.52，p=1.15E-04），而IDO1:rs10108662是与死亡风险最相关的SNP（HR 1.87，95%CI 1.40 - 2.51，p=2.17E-05）。多个不良基因型对死亡和复发风险具有累积影响。在单纯手术组和手术加化疗亚组中，七种治疗特异性变体在两个亚组中与预后的关联方向相反。表达量性状基因座分析表明，6个SNP与其相应的基因表达显著相关。用SNP定义的高危患者的T细胞脱颗粒减少（p=0.02），对癌细胞的细胞毒性降低（p<0.01）。基因表达谱显示高危受试者IDO1表达增加，IL2、PRF和GZMB表达降低。
本研究揭示T细胞癌免疫应答途径的基因变异可影响预后，并可作为早期NSCLC患者治疗效果的预测因子。免疫基因型与T细胞抗肿瘤免疫之间的相关性表明宿主免疫遗传学与NSCLC预后之间存在生物学联系。
图：不利基因型(UFGs)在体外T细胞癌免疫应答和T细胞脱颗粒中的作用